Malaria merupakan penyakit dengan prevalensi tinggi di daerah tropis dan subtropis. Terlebih lagi ditemukan kasus resistensi parasit terhadap obat anti malaria turunan artemisinin sehingga diperlukan kandidat obat baru. Penelitian ini bertujuan mensintesis senyawa (2E)-1-(1-metil-1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona dengan mereaksikan (2E)-1-(1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona dan dimetil sulfat melalui reaksi N-alkilasi dengan katalis basa serta melakukan kajian molecular docking terhadap enzim Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase–thymidylate synthase (PfDHFR-TS). Senyawa (2E)-1-(1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona diperoleh mealui reaksi antara 3-asetilindola dengan benzaldehida menggunakan katalis basa natrium etoksida dengan rendemen 44,46%. N-alkilasi (2E)-1-(1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona diperoleh (2E)-1-(1-metil-1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona 41,55%. Struktur senyawa dikarakterisasi menggunakan Spektrometer ¹H-NMR, ¹³C-NMR dan MS. Hasil simulasi molecular docking menunjukkan energi ikat ligan uji (-7,53 kkal/mol) lebih tinggi dibanding ligan alami WR99210(-8,83 kkal/mol), akan tetapi lebih rendah jika dibandingkan 3 ligan pembandingyang sudah dilaporkan aktif sebagai antimalaria dengan nilai berturut-turut sebesar -6,47; -7,29; -7,20 kkal/mol. Ligan uji memilki sedikit kemiripan interaksi dengan residu asam amino dengan ligan alami, akan tetapi memiliki banyak kemiripan interaksi dengan ligan 3 yang aktif anti malaria, sehingga diduga ligan uji juga memiliki bioaktivitas anti malaria.

Kata Kunci: Malaria, (2E)-1-(1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona, N-alkilasi, (2E)-1-(1-metil-1H-indol-3-il)-3-fenilprop-2-en-1-ona,  PfDHFR-TS, molecular docking.