Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeskripsikan pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional pada konsep Protista terhadap hasil belajar kognitif produk (2) mendeskripsikan pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional pada konsep Protista terhadap hasil belajar kognitif proses (3) mendeskripsikan pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional pada konsep Protista terhadap kemampuan berpikir kreatif peserta didik kelas X SMAN 3 Banjarmasin. Penelitian ini menggunakan pendekatan quasi experiment dengan desain penelitian The Nonequivalent control group design. Sampel penelitian kelas X PMIA 1 dan X PMIA 2 sebagai kelompok eksperimen, kelas X PMIA 3 sebagai kelompok kontrol. Teknik analisis data menggunakan uji Independent Samples Test dari pre-posttest. Hasil penelitian menunjukkan (1) terdapat pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional terhadap hasil belajar kognitif produk peserta didik dengan sig. (2-tailed) 0.017 (2) terdapat pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional terhadap hasil belajar kognitif proses peserta didik dengan sig. (2-tailed) 0.041 (3) terdapat pengaruh penggunaan e-LKPD 3D Pageflip Professional terhadap kemampuan berpikir kreatif peserta didik dengan sig. (2-tailed) 0.007. Dari hasil penelitian, penulis menyarankan diperlukan penyempurnaan terhadap alat evaluasi agar terlihat lebih efektif pengaruhnya dalam meningkatkan hasil belajar kognitif produk dan kognitif proses peserta didik, serta perlunya alat evaluasi agar bisa mengakomodir aspek fluency pada kemampuan berpikir kreatif.