Penelitian ini bertujuan untuk (1) mendeskripsikan pengaruh penggunaan e-LKPD pada konsep Archaebacteria dan Eubacteria terhadap hasil belajar kognitif produk (2) mendeskripsikan pengaruh penggunaan e-LKPD pada konsep Archaebacteria dan Eubacteria terhadap kognitif proses (3) mendeskripsikan perbedaan penggunaan e-LKPD pada konsep Archaebacteria dan Eubacteria terhadap keterampilan berpikir kritis peserta didik kelas X MAN 2 Kota Banjarmasin. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimen semu menggunakan desain The Non-equivalent Control Group Design untuk data hasil belajar dan Posttest-Only Control Group Design untuk keterampilan berpikir kritis. Teknik pengambilan sampel pada penelitian ini dengan menggunakan purposive sampling. Data hasil belajar kognitif produk dan proses dianalisis dengan menggunakan analisis uji Mann-Whitney dan keterampilan berpikir kritis menggunakan analisis uji Independent Sample T-test dengan menggunakan program SPSS 25.0. Hasil penelitian menunjukkan (1) terdapat pengaruh secara signifikan penggunaan e-LKPD terhadap hasil belajar kognitif produk dengan nilai Asym. Sig. (2-tailed) sebesar 0,000 (2) terdapat pengaruh secara signifikan penggunaan e-LKPD terhadap hasil belajar kognitif proses dengan nilai Asym. Sig. (2-tailed) sebesar 0,000 (3) terdapat perbedaan secara signifikan penggunaan e-LKPD terhadap keterampilan berpikir kritis dengan nilai 0,000. Diharapkan dari hasil penelitian tentang penggunaan e-LKPD dapat digunakan dalam proses pembelajaran karena berpengaruh terhadap hasil belajar dan keterampilan berpikir kritis peserta didik.

Kata kunci: penggunaan e-LKPD, konsep Archaebacteria dan Eubacteria,    
     hasil belajar dan keterampilan berpikir kritis.