Ikan baik digunakan sebagai bahan pangan karena mengandung komponen yang diperlukan oleh tubuh seperti protein, lemak, karbohidrat, vitamin, dan garam-garam mineral. Tepung ikan adalah salah satu pengolahan untuk tetap mempertahankan mutu ikan. Tepung ikan lokal masih belum mampu bersaing dengan tepung ikan impor. Oleh karena itu, perlu adanya perbaikan mutu tepung ikan lokal dengan meningkatkan kadar protein dan menurunkan kadar lemak. Upaya dalam permasalahan ini maka dilakukan penelitian yang bertujuan untuk mengetahui lama pemasakan dengan presto yang menghasilkan kadar protein tertinggi dan kadar lemak terendah tepung ikan papuyu, mengetahui pengaruh beda pemasakan antara pengukusan dan pemasakan dengan presto terhadap kadar protein dan lemak tepung ikan papuyu, dan mengetahui pengaruh lama pemasakan yang berbeda terhadap kadar protein dan lemak tepung ikan papuyu. Rancangan penelitian ini adalah RAL dengan enam perlakuan yaitu pengukusan selama 30 menit (T₀), pemasakan dengan autoclave selama 15 menit (T₁), 20 menit (T₂), 25 menit (T₃), 30 menit (T₄), dan 35 menit (T₅). Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan memberikan pengaruh terhadap kadar protein dan lemak tepung ikan papuyu. Kadar protein tertinggi diperoleh pada perlakuan T₅ sebesar 80,04%  dan kadar lemak terendah dengan perlakuan T₅ juga yaitu 8,68%.