Penelian dilaksanakan di Sungai Negara Kabupaten Hulu Sungai Selatan adalah salah satu sungai di Provinsi Kalimantan Selatan yang mempunyai sumber kehidupan bagi masyarakat, tempat hidup bagi tumbuhan air free floating (mengapung di permukaan) yaitu eceng gondok (Eichhornia crassipes) dan kiyambang (Salvinia molesta), serta tumbuhan air ini tempat tinggal mikroorganisme seperti perifiton. Kualitas air di sungai negara mempengaruhi kehidupan biota air. Tujuan penelitian dilaksanakan adalah mengidentifikasi jenis perifiton pada tumbuhan air eceng gondok (Eichhornia crassipes) dan kiyambang (Salvinia molesta), mengetahui struktur komunitas perifiton pada tumbuhan air  eceng gondok (Eichhornia crassipes) dan kiyambang (Salvinia molesta) dan membandingkan struktur komunitas perifiton di setiap stasiun. Jenis perifiton pada tumbuhan air  eceng gondok (Eichhornia crassipes) yang ditemukan selama identifikasi terdiri dari 21 jenis yang terbagi menjadi 5 filum, yaitu Cyanobacteria, Ochrophyta, Bacillariophyta, Chlorophyta, dan Charophyta. Jenis pada tumbuhan air kiyambang (Salvinia molesta) yang ditemukan selama identifikasi terdiri dari 28 jenis yang terbagi menjadi 6 filum, yaitu Cyanobacteria, Ochrophyta, Chlorophyta, Charophyta, Arthropoda dan Ciliophora. Struktur komunitas autotrofik subur dan melimpah, dengan keragaman sedang, keseragaman merata dan tidak ada satupun mendominasi baik di eceng gondok (Eichhornia crassipes) dan kiyambang (Salvinia molesta). Perifiton heterotrof pada kiyambang (Salvinia molesta) kurang subur dan ada jenis yang mendominasi.

Kata kunci : Eceng Gondok, Kiyambang, Kualitas Air, Perifiton