Fungsi sempadan sungai semakin berkurang seiring dengan adanya pembangunan dan kebutuhan akan lahan pemukiman. Perencanaan ini bertujuan untuk mengidentifikasi kondisi eksisting Sungai Gotong Royong, menganalisis daya tampung banjir pada sempadan sungai tersebut, serta merencanakan desain pengelolaan sempadan sungai dengan konsep eko-hidraulik. Perencanaan ini menggunakan metode analisis spasial dengan memanfaatkan data penginderaan jauh, untuk memahami kondisi topografi dan vegetasi di sekitar sungai. Selanjutnya, penggunaan model hidrolika untuk membantu dalam membuat profil melintang sungai serta lebar bantaran banjir. Hasil dari perencanaan ini diidentifikasi bahwa kondisi Sungai Gotong Royong pada hulu sampai tengah sungai terdapat pemukiman padat dibagian tepi kiri dan kanan yang diikuti oleh aktivitas masyarakat membuang limbah cair dan sampah ke sungai, sehingga menyebabkan pendangkalan sungai dibagian hilir. Berdasarkan hasil perhitungan debit banjir rencana yang didapat dengan berbagai kala ulang yaitu 2,2 m³/detik kala ulang 2 tahun, 3,3 m³/detik kala ulang 5 tahun, 4,2 m³/detik kala ulang 10 tahun, dan 5,6 m³/detik kala ulang 20 tahun (Q₂₀) dengan tidak terdapat limpasan atau sungai dapat menampung debit banjir rencana. Rekomendasi penataan sempadan di Sungai Gotong Royong terbagi menjadi 3 yaitu intervensi ekologi untuk segmen aliran pada bagian hilir, intervensi campuran untuk segmen aliran pada bagian tengah, dan intervensi penataan khusus wilayah pemukiman di segmen aliran hulu. Lebar sempadan Sungai Gotong Royong yang didapat pada perencanaan ini yaitu 8 m terdiri dari bantaran banjir 1 m, bantaran longsor 4 m, bantaran ekologi 1,5 m, dan bantaran keamanan 1,5 m.