Sonneratia ovata Backer merupakan tumbuhan mangrove yang dikenal dengan nama pedada atau rambai (Banjar). Bagian kulit batang S. ovata Backer diketahui mengandung senyawa metabolit sekunder. Penelitian ini bertujuan untuk fraksinasi dan karakterisasi senyawa hasil fraksinasi yang terkandung dalam ekstrak metanol kulit batang S. ovata Backer yang berasal dari pesisir pantai Kotabaru, Kalimantan Selatan. Penelitian ini dilakukan melalui beberapa tahap yaitu preparasi sampel, ekstraksi secara maserasi, fraksinasi dengan KVC dan KKG, uji kemurnian, dan karakterisasi fraksi dengan spektrofotometer inframerah. Rendemen ekstrak metanol kulit batang S. ovata Backer diperoleh sebesar 3,81%. Hasil karakterisasi F8.4 dengan spektrofotometer inframerah menunjukkan adanya gugus C=O (1732,42 cm-1 ), C-O (1270,44 cm-1 ), C-H sp3 ulur (2955,07; 2920,43; dan 2851,57 cm-1 ), dan -CH2- tekuk (1462,45 cm-1 ). Fraksi F8.8 menunjukkan adanya gugus C=O (1728,87 cm-1 ), C-O (1269,43 cm-1 ), C=C (1600,40 cm-1 ), C-H sp3 ulur (2956,48; 2921,63; dan 2852,52 cm-1 ), dan C-H sp3 tekuk (1461,98 cm-1 ). Berdasarkan data spektra IR, F8.4 dan F8.8 merupakan senyawa non fenolat atau non aromatis. Senyawa tersebut merupakan senyawa golongan terpenoid atau asam lemak yang teresterifikasi. F8.4 mengandung senyawa dengan gugus ester alifatik, sedangkan F8.8 mengandung senyawa yang memiliki ikatan rangkap pada atom karbonnya dan memiliki gugus ester.