DaerahAliranSungai(DAS)merupakanekosistemyangmerupakantempat unsur organisme dan lingkungan biofisik serta unsur kimia berinteraksisecara dinamis. Apabila fungsi dari suatu DAS terganggu, maka sistem hidrologiakanterganggu,penangkapancurahhujan,resapandanpenyimpananairnyasangatberkurang,atau memilikialiran permukaan (runoff)yangtinggi.

Plankton adalah makhluk yang hidupnya mengapung atau melayang didalam air. Perubahan yang terjadi pada suatu wilayah perairan dapat diketahuidenganmelihatperubahankelimpahanbiotazooplankton.Bentosmerupakanorganisme yang hidup di dasar perairan. Bentos mempunyai peranan yang sangatpenting dalam siklus nutrient di dasar perairan. Organisme ini juga sangat pekaterhadapperubahan lingkungan tempat hidupnya.

Penelitian ini menggunakan metode purposive sampling dengan tujuanuntuk mengetahui debit Sungai, struktur komunitas plankton dan bentos, kualitasair,sertapengaruhdebitsungaiterhadapkualitasairdanstrukturkomunitasplankton dan bentos. Hasil dari penelitian diperoleh yaitu debit tertinggi ada padabagian hilir sungai yaitu sebesar 139,13 m³/s, dan debit terendah terdapat padabagianhuluSungaiSampanahanyaitu86,97m³/s.Ditemukan12jenisspesiesyaituSpirogyra protectaI, Euglena pseudoviridis, Closteriopsis Longissima, Euglenagracilis,AsterionellaFormosa,Synedraacus,Closteriumrectimarginatum,Synedratabulate,Nitzschiabrebissonii,Closterumacerosum,Nitzschiavermicularis,danNitzschiasp.danditemukan3jenisspesiesbentosyaituMyosotella myositis, Lumbricus sp. dan Batissa violacea,. Hasil korelasi PCAbahwa debit sungai mempengaruhi parameter kualitas air seperti temperature, Fe,pH, DO, TDS, Nitrat yang kemudian berpengaruh terhadap kelimpahan planktondanbentos