Kitosan merupakan koagulan yang potensial untuk digunakan dalam pengolahan air sungai yang kotor dan mengandung mikroorganisme di dalamnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui perbandingan kinerja kitosan dalam larutan asam asetat (kitosan-CH₃COOH) dan dalam larutan asam klorida (kitosan-HCl) sebagai koagulan dalam sampel air sungai. Penentuan dosis dan pH optimum dilakukan yaitu dengan menggunakan peralatan jar test. Setelah sampel dikoagulasi, dilakukan pengukuran turbiditas, TDS dan total Coliform menggunakan metode turbidimetri, konduktimetri dan MPN pada masing-masing sampel. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dosis optimum untuk kitosan-CH₃COOH dan kitosan-HCl dalam menurunkan turbiditas dan TDS sebesar 5 mg/L dan total Coliform sebesar     25 mg/L. Penurunan turbiditas dan TDS untuk kitosan-CH₃COOH adalah 94,12%, 0% dan total Coliform sebesar 99,67% serta untuk kitosan-HCl adalah 48%, -3,20% dan 98,73%. Nilai pH optimum untuk menurunkan turbiditas pada kitosan-CH₃COOH dan kitosan-HCl adalah 5 dan 6 serta pH optimum untuk penurunan total Coliform pada kitosan-CH₃COOH dan kitosan-HCl adalah 6 dan 7 sebesar 99,44% dan 97,91%.