Website Pemerintah Daerah merupakan media informasi dan komunikasi antara Pemerintah Daerah dan khalayak tentang segenap hal yang berkaitan dengan daerah terkait. Sebagai salah satu wujud usaha guna memberi pengamanan informasi maupun kritikal harta sehingga pengelola website Pemerintah Daerah di Kalimantan Selatan memerlukan sebuah teknik standar pengetesan keselamatan website terpadu dan merata. Atas dasar permasalahan diatas, penelitian ini akan menguji dan menganalisis tingkat keamanan website Pemerintah Daerah di Kalimantan Selatan. Metode Vulnerability Assessment digunakan untuk mendeteksi berbagai kerentanan. Tool yang digunakan untuk Vulnerability Scanning adalah OWASP ZAP dan Arachni. Hasil penelitian menunjukan secara umum website Pemerintah Daerah di Kalimantan Selatan memiliki tingkat keamanan dengan tingkat risiko rendah. Dengan website Kabupaten Tanah Bumbu yang telah mengimplementasikan fitur pengaman Imunify 360 dan website Kabupaten Balangan yang memiliki 2 kerentanan tingkat risiko tinggi yang harus diperbaiki.

Kata kunci: Keamanan Website, Vulnerability Assessment, OWASP ZAP, Arachni.