DIGITAL LIBRARY



JUDUL:KLASIFIKASI FITUR BERBASIS PSSM DARI ADAPTOR PROTEIN DENGAN 2D CONVOLUTIONAL NEURAL NETWORK
PENGARANG:MUHAMMAD HAEKAL
PENERBIT:UNIVERSITAS LAMBUNG MANGKURAT
TANGGAL:2022-01-10


Proses transduksi sinyal merupakan proses yang berfungsi untuk menyalurkan informasi dari luar kedalam inti sel. Proses tersebut memerlukan signalling complex yang terbentuk dari kombinasi antar protein yang difasilitasi oleh adaptor protein. kegagalan fungsi pada adaptor protein memiliki hubungan erat dengan penyakit pada manusia seperti clathrin yang memiliki keterkaitan dengan penyakit alzeimers. beberapa penelitian telah dilakukan untuk mengidentifikasi adaptor protein menggunakan metode komputasi dengan mengklasifikasi adaptor protein melalui susunan sekuensnya menggunakan metode Convolutional Neural Network (CNN). Teknik Position-Specific Scoring Matrices(PSSM) merupakan cara untuk mengekstrak informasi penting dari sekuen protein, namun memiliki permasalahan berupa ketidakseragaman dimensi yang dihasilkan. Teknik Summed-Up telah diusulkan untuk mengatasi permaslahan tersebut namun memiliki kelemahan berupa tidak dapat mempertahankan informasi posisi dari urutan sekuens protein. Pada penelitian ini penulis mengusulkan penyelesaian masalah tersebut melalui sudut pandang berbeda, yakni menggunakan nilai central tendency. penyelesaian permasalahan penyeragaman dimensi PSSM dapat diatasi menggunakan nilai central tendency. Akurasi terbaik diperoleh pada tahap cross validationdan blind test  menggunakan teknik resizing mode dengan masing-masing nilai sebesar 85,72% dan 79,13%. dibandingkan dengan teknik summed-up yang menghasilkan akurasi sebesar 80,45% dan 75,88%.

Berkas PDF
NODOWNLOAD LINK
1FILE 1



File secara keseluruhan dapat di unduh DISINI