Padatnya lahan permukiman di Daerah Aliran Sungai dengan perilaku masyarakat yang buruk seperti membuang sampah, air cucian kamar mandi maupun buangan tinja secara langsung ke sungai membuat kualitas air Sungai Martapura tercemar. Penelitian  ini  bertujuan  untuk  memahami  mutu  air  sungai,  sehingga  dapat mengidentifikasi daya tampung Segmen Sungai Martapura dengan menggunakan metode  Streeter  Phelps  yang  kemudian  dimodelkan  dalam  program  HEC-RAS versi 5.0.1. Daya tampung beban pencemaran selalu berfluktuasi karena besarnya daya  tampung  dari  setiap  kondisi  masukan  beban  pencemar  dipengaruhi  oleh debit  beban  pencemar  dan  konsentrasi  beban  pencemar  yang  masih  dapat diterima oleh sungai. Hasil penelitian menunjukkan bahwa daya tampung beban pencemaran  memiliki  uji  validasi  model Hecras  kurang  dari  0,2  (20%)  sehingga model  dapat  dikatahan  akurat  untuk  digunakan  sebagai  acuan  simulasi  kondisi sumber  pencemar.  Hasil  analisis  menunjukkan  Besar  daya  Segmen  Sungai Martapura terhadap beban pencemaran organik masih mampu untuk kembali pulih secara  sendirinya.  Kesimpulan  dari  penelitian  ini  yaitu  Daya  tampung  beban pencemaran tertinggi pada kondisi eksisting terdapat di titik 3 sebesar 1,43 Kg/hari untuk parameter BOD, di titik 5 sebesar 17,60 Kg/hari untuk parameter DO, di titik 5 sebesar 71.13 Kg/hari untuk parameter Nitrat, dan di titik 5 sebesar 0,37 Kg/hari untuk parameter Nitrit.  

Kata kunci:  BOD, daya tampung beban pencemaran, DO, HEC-RAS, kualitas air, Nitrat, Nitrit