Keterbatasan bahan ajar fitokimia dalam menunjang proses pembelajaran menyebabkan perlu dikembangkanya bahan ajar berupa e-modul fitokimia pada materi zat warna alami dari tanaman lahan basah berbasis etno-stem untuk meningkatkan higher order thinking skills of environmental problem (HOTSEP) mahasiswa kimia. Tujuan penelitian pengembangan ini untuk mengetahui kelayakan, kepraktisan, dan keefektifan e-modul fitokimia yang dikembangkan. Metode penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah Research and Development (R&D). Model pengembangan penelitian ini menggunakan model ADDIE (Analyze, Design, Development, Implementation and Evaluation). Subjek penelitian terdiri dari 50 mahasiswa Angkatan 2021 Pendidikan Kimia. Data dikumpulkan dengan menggunakan instrument tes, dan non tes (angket respon dan lembar observasi). Teknik analisis data yang digunakan adalah teknik analisis data deskriptif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa e-modul fitokimia yang dikembangkan telah memenuhi kriteria sebagai berikut: (1) Sangat valid, ditinjau dari aspek kelayakan isi, penyajian, bahasa, dan media, (2) Sangat praktis, ditinjau dari hasil keterbacaan pada tahap one-to-one evaluation, (3) Sangat praktis ditinjau dari hasil tahap small group evaluation dan respon mahasiswa tahap field test evaluation, (4) keefektifan Tinggi ditinjau dari hasil pre-test ke post-test. (5) dan nilai n-gain dalam kategori tinggi. Hasil pengembangan menunjukkan bahwa e-modul fitokimia pada materi zat warna alami dari tanaman lahan basah berbasis etno-stem untuk meningkatkan higher order thinking skills of environmental problem (HOTSEP) mahasiswa kimia dinyatakan layak dan dapat digunakan dalam pembelajaran serta efektif dalam meningkatan higher order thinking skills of environmental problem (HOTSEP) mahasiswa Pendidikan kimia.