Pagatan merupakan salah satu kota yang berada di Kabupaten Tanah Bumbu dengan aktivitas laut yang di lakukan oleh masyarakat sebagai sumber makanan sehari-hari. Banyaknya aktivitas yang di lakukan berpotensi memberikan dampak negative terhadap ekosistem perairan. Kondisi ini dapat mempengaruhi kualitas perairan sehingga perlu adanya biomonitoring menggunakan bioindikator. Rastrelliger brachysoma merupakan ikan yang cukup melimpah di perairan Pagatan yang berpotensi sebagai bioindikator. Upaya biomonitoring di lakukan dengan melihat kadar kandungan timbal dan kadmium yang terdapat pada ikan kembung di perairan Pagatan. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis kandungan logam timbal dan kadmium menggunakan metode AAS-Nyala, membandingkan kandungan logam timbal dan cadmium pada daging ikan dan air. Metode yang di gunakan purposive sampling. Hasil analisis kandungan logam berat mengacu pada BPOM Nomor 9 Tahun 2022 tentang batas maksimum cemaran logam berat alam pangan dan PP nomor 22 tahun 2021 Lampiran VIII tentang baku mutu air laut. Penelitian ini menunjukkan bahwa kandungan logam berat timbal dan kadmium di perairan Pagatan pada bagang I secara berurut 0,51 mg/L dan 0,056 mg/L. Sedangkan, pada bagang II 0,56 mg/L dan 0,056 mg/L. Kandungan logam berat timbal dan kadmium pada daging ikan kembung yang terdapat pada bagang I secara berurut 0,001 mg/L dan 0,039 mg/L. Sedangkan, pada bagang II 0,001 mg/L dan 0,146 mg/L