Kolaborasi antara institusi pendidikan dan mitra eksternal merupakan komponen penting dalam mendukung peringkat universitas serta pencapaian Key Performance Indicators (KPI). Banyak institusi di Indonesia masih mencatat data kerja sama secara manual atau menggunakan lembar kerja terpisah, sehingga proses pelacakan dan pelaporan menjadi sulit. Meskipun beberapa institusi telah mengadopsi sistem on-premise, biaya infrastruktur dan pemeliharaan yang tinggi membatasi penerapan secara luas, terutama di institusi yang lebih kecil. Sistem informasi kerja sama berbasis Software as a Service (SaaS) menawarkan solusi yang lebih terjangkau dan mudah dikembangkan (scalable). Perancangan sistem dilakukan dengan pendekatan User-Centered Design (UCD), disertai evaluasi terhadap arsitektur multitenant yang paling sesuai. Arsitektur yang dipilih adalah model separate database per tenant, yang mendukung isolasi data, keamanan, serta fleksibilitas penerapan baik di lingkungan cloud maupun on-premise tanpa perlu modifikasi kode. Prototipe sistem dikembangkan secara iteratif dengan melibatkan pengguna, menghasilkan dokumen perancangan seperti use case diagram, activity diagram, dan skema basis data. Validasi dilakukan menggunakan System Usability Scale (SUS) dan memperoleh skor rata-rata di atas 81,3 yang dikategorikan sebagai Excellent. Salah satu responden memberikan skor lebih rendah karena ketidakhadirannya pada tahap awal pengumpulan kebutuhan, sehingga beberapa kebutuhan di tingkat program studi tidak terpenuhi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pendekatan UCD efektif dalam pengembangan sistem SaaS yang disesuaikan dengan kebutuhan institusi pendidikan, dan pendekatan hibrida yang menggabungkan UCD dengan Lean UX direkomendasikan untuk memperoleh umpan balik dan iterasi yang lebih cepat pada pengembangan selanjutnya.