Kanker merupakan tantangan kesehatan global utama karena tingginya angka kematian serta keterbatasan terapi konvensional yang dapat menimbulkan efek samping dan resistensi obat. Kondisi ini mendorong pencarian agen antikanker baru yang dapat secara spesifik menghambat proliferasi sel kanker, salah satunya melalui target Cyclin-Dependent Kinase 2 (CDK-2). Penelitian ini menganalisis interaksi molekuler tiga senyawa bioaktif, yaitu 2-monolinolenin, sitostenone, dan zingerol, dari fraksi n-heksana daun Paraboea sp. sebagai kandidat penghambat CDK-2. Analisis dilakukan dengan pendekatan molecular docking in silico menggunakan Chimera X 1.9, BIOVIA Discovery Studio 2017, PyRX, PyMOL, dan Dock RMSD. Preparasi protein CDK-2 (PDB ID: 1KE6) dilakukan dengan penyesuaian grid box, simulasi docking, validasi hasil menggunakan RMSD, serta analisis interaksi. Nilai RMSD sebesar 1,499 Å mengindikasikan hasil docking valid. Ketiga senyawa memiliki afinitas negatif, dengan 2-monolinolenin terbaik (-6,7 kkal/mol), mendekati ligan asli LS2 (-9,2 kcal/mol) dilanjutkan sitostenon dan zingerol (-6,4 dan -6,1 kcal/mol). Interaksi mencakup ikatan hidrogen, gaya van der Waals, hidrofobik, dan ikatan karbon-hidrogen. 2-monolinolenin berikatan dengan ASP A:145 dan ASN A:132, menunjukkan kompleks paling stabil. Hasil ini mendukung potensi fraksi n-heksana Paraboea sp. sebagai kandidat antikanker yang layak diuji in vitro dan hepatotoksisitas.