Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji struktur komunitas plankton dan status trofik di perairan Sub DAS Martapura Desa Sungai Batang sebagai dasar penilaian kualitas ekosistem perairan dan pengelolaan sumberdaya perairan yang berkelanjutan. Pengambilan sampel dilaksanakan pada tiga stasiun pengamatan dengan dua periode waktu sampling. Parameter yang dianalisis meliputi kelimpahan plankton, indeks keanekaragaman (H’), indeks keseragaman (E), indeks dominasi (C), serta kadar nitrat dan fosfat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kelimpahan fitoplankton berada pada kisaran 60 - 1160 sel/L, yang tergolong dalam kategori oligotrofik. Nilai indeks keanekaragaman berada pada kisaran 1,3039 – 2,2769(kategori sedang), indeks keseragaman 0,7334 – 0,9591(kategori sangat baik), dan indeks dominasi 0,1224 – 0,3491(kategori rendah), yang mengindikasikan komunitas plankton relatif stabil tanpa adanya genus yang mendominasi. Fitoplankton yang ditemukan terdiri dari 19 genus yang tergabung dalam lima divisi dengan Chlorophyta sebagai divisi yang paling dominan. Nilai status trofik perairan di Sub DAS Martapura Desa Sungai Batang berdasarkan perhitungan TSI yaitu sebesar -2,3 – 2,9 yang termasuk dalam kategori ultra oligotrofik.