Dendrobium merupakan salah satu genus terbesar dari Orchidaceae dengan tingkat keragaman yang sangat tinggi. Genus ini tercatat memiliki lebih dari 1.450 spesies dan tersebar di seluruh dunia, terutama di daerah tropis dan subtropis. Namun, keberadaan Dendrobium di alam telah jarang ditemukan dan tergolong rentan terancam punah. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasikan dan menentukan keragaman genetik plasma nutfah anggrek Dendrobium spp. asal Kalimantan Selatan dengan penanda Internal Transcribed Spacer (ITS). Hasil penelitian ini menunjukan bahwa plasma nutfah Dendrobium memiliki nilai keragaman genetik sebesar 0.051. Adapun pada tingkat intraspesies didapatkan nilai 0.013 (D. anosmum [D1]) dan 0.009 (D. secundum [D2]). Analisis filogenetik (ML dan UPGMA) berhasil mengungkapkan posisi spesifik Dendrobium berdasarkan penanda ITS. Dendrobium spp. asal Kalimantan Selatan ditemukan mengelompok bersama plasma nutfah lain yang didapatkan dari GenBank pada tingkat intraspesies. Sampel D. anosmum (D1) juga mengelompok bersama D. nutantiflorum (MH763847.1), D. jerdonianum (MK169312.1), dan D. nemorale (AB593618.1). Demikian juga dengan sampel D. secundum (D2) yang mengelompok bersama D. draconis (MK522233.1) dan D. amethystoglossum(AB593496.1). Temuan pada penelitian ini dapat mendukung upaya konservasi dan pemuliaan anggrek Dendrobium spp. baik secara lokal maupun global.