Gen coI mengkode Adenosin Trifosfat pada subunit dari enzim yang berperan sebagai transport electron dan menghasilkan (ATP) pada mitokondria. Tujuan penelitian adalah mengetahui jarak genetik fragmen coI mtDNA dan perbedaan struktur CoI pada Gorilla Gorilla, Gorilla berigei, Pan Paniscus, Pan Troglodytes, Homo Sapiens, Homo Neanderthal, dan Homo Denisova. Sampel yang digunakan pada penelitian ini berjumlah 43 dari Gorilla Gorilla, Gorilla berigei, Pan Paniscus, Pan Troglodytes, Homo Sapiens, Homo Neanderthal,dan Homo Denisova. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode Nei dan ANN, dengan mengaplikasikan Microsoft Excel, MAFFT, UGENE dan MATLAB R2020b. penelitian menunjukkan perhitungan jarak individu tertinggi yaitu 167, pada individu dengan kode akses Gorilla Beringei (MH177646) dengan Homo Denisova (FN673705), sedangkan nilai terendah menunjukkan 0, pada perbandingan individu MH177753 dengan MH177717 (Gorilla Beringei), JF727179 dengan JF727166 (Pan Troglodytes), JF727228 dengan JF727231 (Pan Paniscus), MT795654 dengan MG02553 (Homo Neanderthal) dan FR695060 dengan FN673705 (Homo Denisova). Hasil perhitungan jarak populasi menunjukkan nilai tertinggi adalah 149,9111 pada populasi Pan Troglodytes – Gorilla Beringei, sedangkan nilai terendah adalah 39,75 pada populasi Gorilla Beringei - Gorilla Gorilla. Hasil ini menunjukkan bahwa pusat sebaran Famili Hominidae adalah berada pada Gorilla Beringei. Selanjutnya, perbandingan struktur protein Pan Troglodytes (AEQ35657.1) terhadap 12 jenis sekuen yang menunjukkan perbedaan asam amino pada urutan (M332T), (T490A), dan (P508S) terjadi mutasi polaritas yang berubah, hal ini terkait dengan punahnya Pan Troglodytes purba.

Keywords: Fragmen coI mtDNA, COI, Pan Troglodytes