Enteropatogen merupakan bakteri Gram negatif aerob yang dapat ditemukan pada saluran cerna (usus) yang berperan mengganggu penyerapan nutrisi dan meninmulkan stunting pada balita. Faktor sanitasi dan higiene di daerah bantaran sungai yang kurang memadai menjadi suatu faktor terjadinya stunting. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi jenis bakteri enteropatogen Gram negatif aerob pada balita stunting di Desa Keliling Benteng Ulu. Penelitian menggunakan desain observasional deskriptif dengan pendekatan potong lintang. Sampel tinja diambil dari 30 balita stunting sesuai kriteria inklusi. Identifikasi dilakukan secara mikroskopis dan makroskopis. Subjek peneilitian terdiri dari 18 balita laki-laki (60%) dan 12 balita perempuan (40%). Usia balita terbanyak adalah 24–34 bulan (33,3%). Hasil pengecatan Gram didapatkan bakteri basil bersifat Gram negatif. Hasil petumbuhan isolat bakteri secara aerob pada media selektif dan uji biokimia, didapatkan jenis bakteri Escherichia coli (48,3%), Shigella flexneri (48,3%), dan Salmonella paratyphi A (3,23%). Keberadaan Enteropatogen pada balita di wilayah penelitian, diduga karena masyarakat masih menggunakan sumber air sungai (70%) untuk kebutuhan rumah tangga. Kesimpulan pada tinja anak balita stunting ditemukan 3 jenis isolat bakteri Enteropatogen.

Kata-kata kunci: enteropatogen, gram negatif, aerob, tinja, balita stunting