Rendahnya keterlibatan peserta didik dalam proses pembelajaran biologi di SMA diduga disebabkan penggunaan model pembelajaran yang belum berpusat pada peserta didik dan berdampak belum optimalnya hasil belajarnya. Penelitian ini bertujuan menganalisis pengaruh implementasi model PBL berbantuan e-LKPD Canva terhadap hasil belajar kognitif, serta mendeskripsikan hasil belajar afektif peserta didik kelas XI. Jenis penelitian ini menggunakan kuasi eksperimen dengan desain nonequivalent control group. Sampel penelitian terdiri dari dua kelas, yaitu kelas eksperimen (XI-1) dan kelas kontrol (XI-2) yang dipilih dengan teknik purposive sampling. Teknik pengumpulan data menggunakan Pre-Test & Post-Test, lembar observasi afektif. Data dianalisis menggunakan SPSS versi 25 dengan uji normalitas, homogenitas, uji-t, dan perhitungan N-Gain. Hasil menunjukkan bahwa implementasi model PBL berbantuan e-LKPD Canva mengindikasikan adanya pengaruh terhadap hasil belajar dengan nilai signifikansi 0,000 (p < 0,05). Selain itu, hasil belajar afektif peserta didik pada kelas eksperimen dan kelas kontrol berada pada kategori baik. Temuan ini menunjukkan bahwa pembelajaran berbasis masalah berbantuan E-LKPD mampu mendorong keterlibatan aktif peserta didik, yang berkontribusi pada hasil belajar kognitif dan afektif pada materi transpor dan pertukaran zat pada tubuh manusia.